Complicatiile de encefalopatie variaza, uneori poate sa nu existe nicio complicatie, alterori se pot produce deficiente mentale profunde care duc la moarte. Complicatii encefalopatiei par a fi generate de o alta afectiune care sta la baza. Iata cateva exemple de complicatii in acest sens:

• Encefalopatia hepatica produce umflarea creierului, coma sau deces
• Encefalopatia metabolica produe iritabilitate, letargie, depresie, tremor ocazional, coma sau deces.
• Encefalopatia anoxica conduce la o gama larga de complicatii printre care schimbarile de personalitate, leziuni grave sau chiar deces
• Encefalopatie uremica care produce letargie, halucinatii, stupoare, spasme musculare, convulsii sau deces
• Encefalopatia Hashimoto care produce confuzie, intoleranta la caldura, dementa
• Encefalopatia Wernicke induce confuzie mentala, pierderi de memorie, scaderea capacitatii de miscare a ochilor
• Encefalopatia spongiforma bovina sau "boala vacii nebune" produce ataxie, dementa si mioclonii sau spasme musculare, fara nici un ritm sau model
• Encefalopatia Shigella produce dureri de cap, intepenirea gatului, delir, convulsii, coma